分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件（三）

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记录一下检索到一篇分子动力学模拟数据后处理的软件。

感谢程序的原作者！

附件下载：

https://github.com/lingtikong/strfac

主要功能：

    1. Structure factor calculation;

    2. Structure factor evolution;

    3. Structure factor distribution;

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    4. Pair correlation calculation;

    5. Planar pair-correlation calculation;

    6. Pair correlation of desired type pair;

    7. Pair correlation of desired groups;

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    8. HA bond analyse;

    9. HA bond map of one image;

   10. Warren-Cowley CSRO parameter;

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   11. dump each selected atom as a single frame

   12. Self-intermediate scattering function

   13. Output indices of atoms in selection

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   14. New selection;

Figure 1 主要功能

Figure 2 安装过程

第一步输入：make，下图为安装成功的界面。

Figure 3 操作过程

第1步：输入lammps轨迹文件；

第2步：随便输入一个数字，调出程序可以计算的数据。

Figure 4 操作过程

第3步：数据计算的内容，以HA键对分析为例；

第4步：输入数字好像不合适，但是回车就可以进行到下一步；

第5步：输入截断半径；

第6步：输出文件的名字。

Figure 5 输出结果

下面是HA键对分析的结果。

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以上说明过程均没有测试结果是否准确，大家需要自行验证，慎用慎用！

以上是我们分享的一些经验或者文章的搬运，或有不足，欢迎大家指出，如有侵权，请联系我立马删除！

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