Lammps 微信公众号推荐：SimulationWorld

最新推荐文章于 2024-05-13 18:14:25 发布
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文章标签： LAMMPS linux
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推荐一个比较不错关于lammps的微信公众号：SimulationWorld （可扫图中二维码添加）

主要讲了一些基本的linux系统操作和lammps分子动力学基础知识，更新比较勤。同时公众号中有优酷和网易云课堂视频的推荐，
视频是由老师亲自录制的，主要是关于lammps、gromacs和VMD的一些操作与模拟理论，其中比较基础的是免费视频，大家可根据自身情况选择。
 

欢迎有兴趣的同学与老师关注！！！
po390
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lammps中文教程
lammps_jiayou的博客
04-20 3299
lammps中文教程
lammps常见设置误区：“刚体”和“固定”命令分不清
lammps_jiayou的博客
05-04 4000
在lammps模拟中，有“刚体”和“固定”的设置，在平时咨询过程中，发现还有小伙伴对两者的区别分不大清楚。 在设置”刚体“的时候使用固定的命令，反之也有。 ”刚体“和”固定“的设置有相同点，也有不同点。 （1）相同点 被设定为”刚体“以及”固定“的结构，原子之间的间距保存相对固定，在模拟过程中，这个结构不会发生变形。 换一句描述，可以理解为：”刚体“是一个刚体，被“固定”的结构也是一个刚体，这是两者之间相同点。 （2）不同点 第一个不同：“刚体”可以移动，被“固定”的结构静止不动。 比如，在摩擦模拟中，磨粒
开始进行lammps手册的学习啦，跟着Manual一边翻译一边做吧！（转载）
weixin_30755393的博客
05-06 1321
转载自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_64813e370100ngsz.html 注明：黄色部分基本上为不懂的部分，红色字体为所做注释 一、各种文件的介绍： 1 in file:建立该文件以便程序的写入 2 log file：写入状态信息（if the switch is used?） 3 screen file决定结果的是否进行屏幕输出 4 var...
LAMMPS安装全套解决方案
爱思慕理（iSimuLy）
10-02 1万+
网络上有很多教程教大家安装，但大多有点老旧了，跟不上LAMMPS版本的发展。官网上有ubuntu系统下的预编译版，但完全不推荐；因为LAMMPS包含的包很多，不需要所有的都安装上。全安装上，在一定程度上会影响到计算效率，这有点像你去旅游，背了很多根本用不到的沙袋走路。 在任何类Unix操作系统下安装软件，不外乎如下步骤： 检查依赖包 2. 安装没有的依赖包 3.按说明安装软件，并设置路径 下面...
lammps软件介绍与使用
qq_44963682的博客
06-15 8158
简单介绍了lammps软件的原理与使用、建模的方法、势函数的获取、in文件书写示例。
lammps基础命令及教程
热门推荐
m0_60787307的博客
10-23 2万+
原创YJ学长LAMMPS交流站javascript:void(0); 01 lammp常用命令 1.units命令 2.dimension命令 3.boundary命令 3.atom_style命令 4.neighbor命令 5.neigh_modify命令 6.atom_style命令 7.pair_style命令 8.bond_style命令 9.angle_style命令 10.dihedral_style命令 11.improper_style命令 12.spe..
lammps数据后处理：Python Ovito 统计键长分布
lammps_jiayou的博客
10-20 2712
默认的命令仅计算当前帧的键长分布，添加TimeAveragingModifier()可对所有帧的键长分布进行统计平均，最终的结果输出到bond-length-distr.txt文件。python ovito模块中有个BondAnalysisModifier功能，可以分析键长和键角的分布，和ovito pro版本的键角分析功能是一样的。
lammps数据后处理：Python Ovito 统计角度分布
lammps_jiayou的博客
10-24 1394
本文介绍如何使用python ovito模块输出lammps模拟体系的角度分布。
lammps后处理技巧：速度云图的绘制
lammps_jiayou的博客
05-06 3997
大家好，我是小马老师。 本文介绍lammps模拟后处理中速度云图的绘制方法。 在lammps中，云图的绘制应用较多，如应力、密度、温度、速度等等，绘制方法基本一致。 ovito可以根据单原子的参数绘制云图，但是总体效果不是很理想，因为原子之间的量相对离散，绘制出来之后得到的图像过度不平滑。 参考有限元的思想，把整个体系划分为若干个小的单元，一个单元可包含多个原子，计算单元的量（如温度、速度），以此进行绘图，得到的图像就会想的比较平滑。 compute chunk/atom命令可把体系划分为若干个单元（chu
lammps数据后处理：模拟完成后补充计算rdf方法2
lammps_jiayou的博客
11-11 1620
rdf的数据一般是在lammps模拟中使用compute rdf命令计算出来，如果在模拟时没有写rdf代码，模拟完成后也是可以补救的。
lammps中文手册_LAMMPS学习系列（1）
weixin_39716921的博客
12-01 7602
LAMMPS软件编译欢迎关注我的公众号：LAMMPS爱好者本LAMMPS系列与公众号每日不定时同步更新，有需要的同学欢迎关注~LAMMPS模拟软件的功能有很多：微观结构演化结构优化过渡态搜索热导率计算等等（太多了，有兴趣的可自行百度）。。。。。其中它最常用的功能就是模拟微观结构的演化，即观察粒子在合理物理环境（符合牛顿定律）下的演化情况。打个比方，我们高中时期学物理时经常会碰到这样的一个问题：两个...
lammps输出MSD（均方根位移）详解及示例教程
m0_60787307的博客
11-30 1万+
[lammps第十五讲]lammps输出MSD（均方根位移）详解及示例教程 原创一直陪着你的LAMMPS交流站2021-10-23 11:45 收录于话题 #lammps21个内容 #lammps后处理17个内容 大家好，前面小编讲解了一期RDF（径向分布函数）的详解及LAMMPS输出过程，就有很多小伙伴问到小编MSD的LAMMPS输出过程，所以本期小编本期介绍下MSD（均方根位移）的输出办法，小编就把自己学到的在这里跟大家分享，也算是小编学习过程中的一个笔记。 本教程也是...
LAMMPS，ParaDiS
fakerth的博客
05-09 565
LAMMPS 是一种经典的分子动力学 (MD) 代码，用于模拟液态、固态或气态粒子的集合。它可以使用各种原子间势（力场）和边界条件对原子、聚合物、生物、固态（金属、陶瓷、氧化物）、粒状、粗粒或宏观系统进行建模。它可以对尺寸从几个粒子到数十亿个粒子的 2d 或 3d 系统进行建模。LAMMPS 可以在单台笔记本电脑或台式机上构建和运行，但专为并行计算机而设计。它将在串行和任何支持MPI消息传递库的并行计算机上运行。这包括共享内存多核、多 CPU 服务器以及分布式内存集群和超级计算机。 LAMMPS 的部分内容
【LAMMPS学习】八、基础知识(6.5)PyLammps 教程
最新发布
荷塘阅色
05-13 1449
PyLammps是 LAMMPS 的 Python 包装类，可以单独创建或使用现有的lammps Python 对象。与使用 Python ctypes 编写的 C 风格 LAMMPS 库接口的lammps包装器相比，它为常见的 LAMMPS 功能创建了一个更简单、更“Pythonic”的接口。使用 Python 与 LAMMPS 文档页面讨论了lammps包装器。与扁平的ctypes界面不同，PyLammps 公开了一个可发现的 API。它不再需要了解底层 C++ 代码实现的知识。
【LAMMPS学习】八、基础知识(5.1)有限尺寸球形和非球形粒子
荷塘阅色
04-28 1703
典型的 MD 模型将原子或粒子视为点质量。有时需要一个具有有限尺寸粒子的模型，例如球体或椭球体或广义非球体。不同之处在于，此类粒子具有惯性矩、旋转能和角动量。旋转是由与其他粒子相互作用产生的扭矩引起的。
LAMMPS学习总结5
weixin_45896923的博客
04-15 8223
LAMMPS学习总结5
入门必备-经典的分子动力学软件LAMMPS简版手册
hdpai2018的博客
09-29 6672
文章来源：“分子动力学”公众号 链接：https://mp.weixin.qq.com/s/VcazPnWDNDIOorShWtKWbA 本部分大致介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷 1、什么是LAMMPS?；LAMMPS是一个经典的分子动力学软件；LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序 2、LAMMPS的功能；总体功能；可以串行和并行计算；分布式MPI策略；模拟空间的分解并行机制 一、简介 1、什么是LAMMPS LAMMPS是一个经典的分子动力学代码，可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综。也可以采用
分子云，一个关于计算化学和分子力学的微信公众号
lys_mangrove的博客
12-05 1981
有做计算化学的朋友欢迎关注，本人在微信上开通了一个微信公众号，用于推送量子化学和分子力学的基础知识，文章采用比较轻松通俗的语言来解 释计算化学中的一些问题。楚辞之外公众号后期还会推送常用的软件使用方法以及服务器（超级计算机）的一些维护知识，欢迎有兴趣的朋友关注，相互交流，给点建议。谢谢。关注的方法可以通过图片中的二维码识别，也可以在微信公众号中搜索：分子云，进行关注。
lammps免费学习资料汇总
lammps_jiayou的博客
08-14 3762
​大家好，我是小马老师。 公众号开通以来，文章越来越多，为方便大家查询，今天抽时间把公众号文章进行了汇总和分类。 公众号文章主要分为两大类：lammps基础知识和lammps案例。 lammps基础知识：包括命令讲解、建模、使用技巧等等，大约80余篇文章。 lammps案例：包括基础案例和付费阅读案例，大约40多个案例，付费阅读案例10个左右。 我把这两个链接做到公众号首页，需要的查询的时候直接到公众号页面查询即可，如果大家有更好的方法，可以留言告诉我。 公众号：lammps加油站 QQ交
LAMMPS经典案例解析：从入门到高级模拟
LAMMPS,全称为Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator（大规模原子/分子并行模拟器），是一个功能强大的通用分子动力学模拟软件，特别适用于材料科学、生物物理、化学和工程等领域。本篇教程由...
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