uniPort: A unified computational framework for single-cell data integration with optimal transport


Uniport Paper Here

博客内容仅我个人理解,并且内容也仅根据我的个人需求而有所删减,没有任何解说可以代替原文,好论文值得你完整阅读

主题

uniPort算法主要用于集成单细胞RNA和ATAC数据,然后进行下游数据分析和应用

创新点/贡献

  1. 将Autoencoder和unbalanced optimal transport结合,算是一种新颖的集成数据算法
  2. UniPort可以整合共同基因和数据集特定基因
  3. Minibatch-UOT的minibatch策略可以提高大数据集的计算效率,unbalance可以处理异构数据集成
  4. 可以通过另一个数据集中的共同基因来归纳一个数据集中的独特基因而无需从头训练(神经网络优势)。

uniPort算法理论

在这里插入图片描述

我一开始以为是将数据拉进潜在空间,然后用UOT直接对齐数据,结果只是用UOT计算损失,用于指导VAE训练。

其实细想也对,作者希望结果是两个数据对齐的,UOT的wasserstien distance就反映了数据是否对齐,这样就可以作为损失,训练VAE产生的结果趋近对齐,聪明!

内容概要:本文详细介绍了软考高项(高级信息系统项目管理师)的备考策略、考试内容及应试技巧。首先,文章强调了二八法则的应用,即80%的时间精力应放在项目管理领域的核心知识点上,如五大过程组、十大知识域等,20%的时间放在IT知识和组织级项目管理上。备考分为三个阶段:基础阶段通过精读教材、绘制思维导图夯实基础;强化阶段通过真题训练、案例分析提升实战能力;冲刺阶段通过论文押题、模拟考试做好最后准备。文章还特别指出,计算题和论文写作是考试的重点和难点,需重点练习。此外,针对不同地区的考生,提供了差异化的备考建议,如一线城市侧重新技术应用,中西部地区关注乡村振兴信息化等。最后,文章提醒考生关注机考模拟系统的开放时间和准考证打印时间,确保顺利参加考试。 适合人群:准备参加软考高项考试的考生,特别是有一定项目管理基础并希望系统复习、提高应试能力的考生。 使用场景及目标:①帮助考生高效利用有限时间,集中精力复习核心知识点;②通过模拟练习和真题训练,提升计算题和论文写作的能力;③结合实际案例,掌握项目管理全流程知识,提高考试通过率。 其他说明:备考过程中,考生应结合自身实际情况,灵活调整学习计划。同时,充分利用各种学习资源,如精讲课视频、直播课、历年真题等,不断巩固和深化对知识点的理解。考试改革后,机考成为主流,考生需提前熟悉机考系统,确保考试时能够熟练操作。
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