智源和港中文联合提出首个多功能3D医学多模态大模型（文本、定位和分割任务）

智源和香港中文大学联合提出的 M3D 系列工作，包括 M3D-Data, M3D-LaMed, 和 M3D-Bench, 从数据集、模型和测评全方面推动 3D 医学图像分析的发展。

1. M3D-Data 是目前最大的 3D 医学图像数据集，包括 M3D-Cap (120K 3D 图文对), M3D-VQA (510K 问答对)，M3D-Seg（150K 3D Mask），M3D-RefSeg (3K 推理分割)共四个子数据集。
2. M3D-LaMed 是目前最多功能的 3D 医学多模态大模型，能够解决文本（疾病诊断、图像检索、视觉问答、报告生成等），定位（目标检测、视觉定位等）和分割（语义分割、指代分割、推理分割等）三类医学分析任务。
3. M3D-Bench 能够全面和自动评估 8 种任务，涵盖文本、定位和分割三个方面，并提供人工校验后的测试数据。

我们最早于 2024年4月 发布了数据集、模型和代码。近期，我们提供了更小和更强的M3D-LaMed-Phi-3-4B模型，并增加了线上 demo 供大家体验！最新进展请关注 GitHub 仓库的更新 ，如果有任何疑问和建议可以及时联系，欢迎大家讨论和支持我们的工作。

• 论文：https://arxiv.org/abs/2404.00578
• 代码：https://github.com/BAAI-DCAI/M3D
• 模型：https://huggingface.co/GoodBaiBai88/M3D-LaMed-Phi-3-4B
• 数据集：https://github.com/BAAI-DCAI/M3D?tab=readme-ov-file#data
• 线上Demo：https://e7e9a4f07f93722d27.gradio.live/ （国内体验地址在评论区）

我们能为医学图像相关研究者提供什么？

1. M3D-Data, 最大的 3D 医学多模态数据集；
2. M3D-Seg, 整合了几乎所有开源 3D 医学分割数据集，共计 25 个；
3. M3D-LaMed, 支持文本、定位和分割的最多功能的 3D 医学多模态大模型，提供了简洁清晰的代码框架，研究者可以轻易魔改每个模块的设置；
4. M3D-CLIP，基于M3D-Cap 3D 图文对，我们训练了一个图文对比学习的 M3D-CLIP 模型，共提供其中的视觉预训练权重 3DViT；
5. M3D-Bench，全面和清晰的测评方案和代码。
6. 本文涉及的所有资源全部开放，希望能帮助研究者共同推进 3D 医学图像分析的发展。

摘要

医学图像分析对临床诊断和治疗至关重要，多模态大语言模型 (MLLM) 对此的支持日益增多。然而，先前的研究主要集中在 2D 医学图像上，尽管 3D 图像具有更丰富的空间信息，但对其的研究和探索还不够。

本文旨在利用 MLLM 推进 3D 医学图像分析。为此，我们提出了一个大规模 3D 多模态医学数据集 M3D-Data，其中包含 120K 个图像-文本对和 662K 个指令-响应对，专门针对各种 3D 医学任务量身定制，例如图文检索、报告生成、视觉问答、定位和分割。此外，我们提出了 M3D-LaMed，这是一种用于 3D 医学图像分析的多功能多模态大语言模型。此外，我们引入了一个新的 3D 多模态医学基准 M3D-Bench，它有助于在八个任务中进行自动评估。

通过综合评估，我们的方法被证明是一种稳健的 3D 医学图像分析模型，其表现优于现有解决方案。所有代码、数据和模型均可在以下网址公开获取：https://github.com/BAAI-DCAI/M3D。

数据集

数据集统计情况

M3D-VQA 数据集分布

我们整合了几乎所有开源的3D医学分割数据集，组成了M3D-Seg

模型

M3D-LaMed 模型结构

实验

图文检索

在 3D 图文检索中，模型旨在根据相似性从数据集中匹配图像和文本，通常涉及两个任务：文本到图像检索 (TR) 和图像到文本检索 (IR)。

由于缺乏合适的方法，我们将2D医学的代表模型PMC-CLIP应用于3D图文检索中，我们发现由于缺乏空间信息，几乎无法和3D图文检索模型对比。

报告生成

在报告生成中，该模型根据从 3D 医学图像中提取的信息生成文本报告。

封闭式视觉问答

在封闭式视觉问答中，需要为模型提供封闭的答案候选，例如A,B,C,D，要求模型从候选中选出正确答案。

我们发现在医学领域 M3D-LaMed 超过通用的 GPT-4V。

开放式视觉问答

在开放式视觉问答中，模型生成开放式的答案，不存在任何答案提示和候选。

我们发现在医学领域 M3D-LaMed 超过通用的 GPT-4V。不过需注意目前GPT-4V限制了医疗相关问题的回答。

定位

定位在视觉语言任务中至关重要，尤其是涉及输入和输出框的任务。在输出框的任务，如指代表达理解 (REC) ，旨在根据指代表达在图像中定位目标对象。相比之下，在输入框的任务，如指代表达生成 (REG) ，要求模型根据图像和位置框生成特定区域的描述。

分割

分割任务在 3D 医学图像分析中至关重要，因为它具有识别和定位功能。为了解决各种文本提示，分割分为语义分割和指代表达分割。对于语义分割，该模型根据语义标签生成分割掩码。指代表达分割需要根据自然语言表达描述进行目标分割，需要模型具有一定的理解和推理的能力。

分布外 (OOD) 问题的案例研究

我们在 OOD 对话中测试了 M3D-LaMed 模型，这意味着所有问题都与我们的训练数据不相关。我们发现 M3D-LaMed 具有很强的泛化能力，可以对 OOD 问题产生合理的答案，而不是胡言乱语。在每组对话中，左侧的头像和问题来自用户，右侧的头像和答案来自 M3D-LaMed。

模型具有很强的推理能力和泛化能力

我们最新训练的更小的 M3D-LaMed-Phi-3-4B 模型具有更好的表现，欢迎大家使用！GoodBaiBai88/M3D-LaMed-Phi-3-4B · Hugging Face

报告生成测评结果

封闭式VQA测评结果

在TotalSegmentator上测评的语义分割Dice结果

总结

我们 M3D 系列研究促进了使用 MLLM 进行 3D 医学图像分析。具体来说，我们构建了一个大规模 3D 多模态医学数据集 M3D-Data，其中包含 120K 3D 图像文本对和 662K 指令响应对，专为 3D 医学任务量身定制。

此外，我们提出了 M3D-LaMed，这是一个通用模型，可处理图像文本检索、报告生成、视觉问答、定位和分割。此外，我们引入了一个综合基准 M3D-Bench，它是为八个任务精心设计的。我们的方法为 MLLM 理解 3D 医学场景的视觉和语言奠定了坚实的基础。

我们的数据、代码和模型将促进未来研究中对 3D 医学 MLLM 的进一步探索和应用。希望我们的工作能够为领域研究者带来帮助，欢迎大家使用和讨论。

如何学习大模型 AI ？

由于新岗位的生产效率，要优于被取代岗位的生产效率，所以实际上整个社会的生产效率是提升的。

但是具体到个人，只能说是：

“最先掌握AI的人，将会比较晚掌握AI的人有竞争优势”。

这句话，放在计算机、互联网、移动互联网的开局时期，都是一样的道理。

我在一线互联网企业工作十余年里，指导过不少同行后辈。帮助很多人得到了学习和成长。

我意识到有很多经验和知识值得分享给大家，也可以通过我们的能力和经验解答大家在人工智能学习中的很多困惑，所以在工作繁忙的情况下还是坚持各种整理和分享。但苦于知识传播途径有限，很多互联网行业朋友无法获得正确的资料得到学习提升，故此将并将重要的AI大模型资料包括AI大模型入门学习思维导图、精品AI大模型学习书籍手册、视频教程、实战学习等录播视频免费分享出来。

第一阶段（10天）：初阶应用

该阶段让大家对大模型 AI有一个最前沿的认识，对大模型 AI 的理解超过 95% 的人，可以在相关讨论时发表高级、不跟风、又接地气的见解，别人只会和 AI 聊天，而你能调教 AI，并能用代码将大模型和业务衔接。

• 大模型 AI 能干什么？
• 大模型是怎样获得「智能」的？
• 用好 AI 的核心心法
• 大模型应用业务架构
• 大模型应用技术架构
• 代码示例：向 GPT-3.5 灌入新知识
• 提示工程的意义和核心思想
• Prompt 典型构成
• 指令调优方法论
• 思维链和思维树
• Prompt 攻击和防范
• …

第二阶段（30天）：高阶应用

该阶段我们正式进入大模型 AI 进阶实战学习，学会构造私有知识库，扩展 AI 的能力。快速开发一个完整的基于 agent 对话机器人。掌握功能最强的大模型开发框架，抓住最新的技术进展，适合 Python 和 JavaScript 程序员。

• 为什么要做 RAG
• 搭建一个简单的 ChatPDF
• 检索的基础概念
• 什么是向量表示（Embeddings）
• 向量数据库与向量检索
• 基于向量检索的 RAG
• 搭建 RAG 系统的扩展知识
• 混合检索与 RAG-Fusion 简介
• 向量模型本地部署
• …

第三阶段（30天）：模型训练

恭喜你，如果学到这里，你基本可以找到一份大模型 AI相关的工作，自己也能训练 GPT 了！通过微调，训练自己的垂直大模型，能独立训练开源多模态大模型，掌握更多技术方案。

到此为止，大概2个月的时间。你已经成为了一名“AI小子”。那么你还想往下探索吗？

• 为什么要做 RAG
• 什么是模型
• 什么是模型训练
• 求解器 & 损失函数简介
• 小实验2：手写一个简单的神经网络并训练它
• 什么是训练/预训练/微调/轻量化微调
• Transformer结构简介
• 轻量化微调
• 实验数据集的构建
• …

第四阶段（20天）：商业闭环

对全球大模型从性能、吞吐量、成本等方面有一定的认知，可以在云端和本地等多种环境下部署大模型，找到适合自己的项目/创业方向，做一名被 AI 武装的产品经理。

• 硬件选型
• 带你了解全球大模型
• 使用国产大模型服务
• 搭建 OpenAI 代理
• 热身：基于阿里云 PAI 部署 Stable Diffusion
• 在本地计算机运行大模型
• 大模型的私有化部署
• 基于 vLLM 部署大模型
• 案例：如何优雅地在阿里云私有部署开源大模型
• 部署一套开源 LLM 项目
• 内容安全
• 互联网信息服务算法备案
• …

学习是一个过程，只要学习就会有挑战。天道酬勤，你越努力，就会成为越优秀的自己。

如果你能在15天内完成所有的任务，那你堪称天才。然而，如果你能完成 60-70% 的内容，你就已经开始具备成为一名大模型 AI 的正确特征了。

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