新版 ImageGP 带你轻松实现生信数据在线分析和可视化

「超级云讲堂第61期」

指导单位:中国计算机学会高性能计算专业委员会

主办单位:北京超级云计算中心

直播平台:bilibili、视频号、抖音

本期嘉宾:陈同博士,中国中医科学院副研究员,微信公众号"生信宝典"发起人,iMeta期刊联合创办人、执行主编。

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第61期 内容预告

基于新版ImageGP 的

生信数据在线分析和可视化

生物信息数据分析和可视化是目前科研工作者的一个大的需求。ImageGP 可以在线生成常见的线图、柱状图、散点图、箱线图、集合图、热图和直方图等。用户只要粘贴数据矩阵,就可以快速出图。同时 ImageGP 还支持火山图、富集分析泡泡图、主成分分析类图等 和 4 种微生物领域的功能预测和生物标志物鉴定分析,包括 FAPROTAX, BugBase, PICRUSt 和 LEFSe。在满足方便易用的同时,ImageGP 也提供了灵活性,可以设置常见参数、调整样式,输出发表质量的图。新版的 ImageGP 支持客户上传个人数据、差异分析、WGCNA 分析、进化树绘制等。更多功能还在不断添加中。

内容章节

01 ImageGP 基本介绍

02 ImageGP 绘图和分析功能演示

03 ImageGP 后续的开发

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特邀讲师

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陈同 博士,中国中医科学院副研究员

研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇;开发在线绘图平台 ImageGP,使用近 50 万人次;运营有十余万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1200 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平杂志。

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「超级云讲堂」中国计算机学会高性能计算专业委员会指导,北京超级云计算中心主办,是集科研、学术、教育为一体的在线科普、公益直播讲堂。邀请各领域技术大咖、知名学者解读最新、最热科研、科普话题,分享基于云上科研环境的应用经验与成功实践。致力于打造一个易参与、乐分享、勤思考、善实践的科研、科普、学术交流平台,搭建科研、教研工作者与公众的纽带和桥梁,不但注重科学思想的传播,更注重不同领域思想的交叉和碰撞,志在营造多元的、思辨的科学文化交流氛围。

目前云讲堂已连续开播60期,B站粉丝数量1.1W+,累计观看次数达500,000+,并拥有31个直播交流群,群活跃粉丝数量6,000+。

往期课程观看链接:

https://space.bilibili.com/505497082

直播扣扣交流群号:794834983

直播平台:bilibili、视频号、抖音

科普、公益、多元、思辨

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