记录一下折腾Ubuntu 20.04部署lammps GPU加速 2AMD 7742 1NVIDIA 3090

最新推荐文章于 2024-04-05 15:33:28 发布

qq_564515064

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文章标签： ubuntu linux 运维

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_25439183/article/details/121285260

版权

本人技术小白，目前已经安装好Ubuntu 20.04，nvidia驱动版本470.86

安装cuda

CUDA Toolkit 11.5 Downloads | NVIDIA Developer

登录nvidia官方网站下载最新版本cuda 11.5

这里本人用的是离线安装的方法：

cd Downloads/    #默认下载到了Downloads文件路径下
sudo ./cuda_11.5.0_495.29.05_linux.run     #安装cuda

安装完成后，验证安装是否成功。

cd /usr/local/cuda-11.5/samples/1_Utilities/deviceQuery
sudo make
./deviceQuery

输出以下信息，搞定！！！

其实以上教程百度有很多，安装cuda也简单。折腾了哥们儿好几天的难题就在下面这一堆里了。

安装lammps

度娘lammps官网，各位自行下载吧，我这里现在死活连不上官网了。（顺便吐槽一下公司的垃圾网速）

我这里下载到的文件名

tar -xvf lammps-stable.tar.gz
cd lammps-29Sep2021/lib/gpu
sudo vim Makefi.linux

修改内容

CUDA_HOME = /usr/local/cuda-11.5

CUDA_ARCH = -arch=sm_86   #这里要根据显卡核心架构修改对应参数，对照片在下图。
                          #这里也要感谢另外一篇文章，最初是跟着大佬的教程来操作的。
                          #https://blog.csdn.net/qyb19970829/article/details/105463480

计算精度直接用了默认参数。

修改完成后，保存退出。

sudo make -f Makefile.linux -j 128

这里报错了，

nvcc -I/usr/local/cuda-11.5/include -DUNIX -O3 --use_fast_math -DLAMMPS_SMALLBIG -Xcompiler -fPIC -arch=sm_86 -D_SINGLE_DOUBLE --fatbin -DNV_KERNEL -o .//dipole_long_lj.cubin .//lal_dipole_long_lj.cu
make: nvcc: Command not found
make: *** [Nvidia.makefile:58: dipole_long_lj_cubin.h] Error 127

折腾人的来了，

sudo vim Makefi.linux

修改
NVCC = nvcc 
为
NVCC = /usr/local/cuda-11.5/bin/nvcc

再次编译，瞬间完成。-j 128果然够快。

cd lammps-29Sep2021/src/
make yes-gpu
sudo make mpi -j 128

编译完成。

找lammps自带的例子跑一下试试去。

cd lammps-29Sep2021/examples/DIFFUSE/
mpirun -np 4 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 -in in.msd.2d

继续报错了，吐血。错误如下

[proxy:0:0@caslx-MZ72-HB0-00] HYDU_create_process (utils/launch/launch.c:74): execvp error on file lmp_mpi (No such file or directory)
[proxy:0:0@caslx-MZ72-HB0-00] HYDU_create_process (utils/launch/launch.c:74): execvp error on file lmp_mpi (No such file or directory)
[proxy:0:0@caslx-MZ72-HB0-00] HYDU_create_process (utils/launch/launch.c:74): execvp error on file lmp_mpi (No such file or directory)
[proxy:0:0@caslx-MZ72-HB0-00] HYDU_create_process (utils/launch/launch.c:74): execvp error on file lmp_mpi (No such file or directory)

2021 11 26

烂尾了，另开一篇：

Ubuntu 20.04+NVIDIA驱动+Cuda11.5+FTTW3.3.10+lammps GPU加速_qq_564515064的博客-CSDN博客