多变量COX回归 R语言

最新推荐文章于 2022-10-15 16:57:11 发布
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分类专栏： 深度学习 文章标签： r语言 python 数据库
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library("survival")
library("survminer")
res <- coxph(Surv(Survival_time, Death)~cluster_0 + cluster_1 + cluster_2 + cluster_3 + cluster_4 + cluster_5 + cluster_6 + cluster_7 + cluster_8 + cluster_9 + cluster_10 + cluster_11 + cluster_12 + cluster_13 + cluster_14 + cluster_15 + cluster_16 + cluster_17 + cluster_18 + cluster_19 + cluster_20 + cluster_21+ cluster_22 + cluster_23 + cluster_24 + cluster_25 + cluster_26 + cluster_27 + cluster_28 + cluster_29, data=datas)

summary(res)
ggforest(res, datas)
res <- coxph(Surv(Survival_time, Death)~cluster_pro_0 + cluster_pro_1 + cluster_pro_2 + cluster_pro_3 + cluster_pro_4 + cluster_pro_5 + cluster_pro_6 + cluster_pro_7 + cluster_pro_8 + cluster_pro_9 + cluster_pro_10 + cluster_pro_11 + cluster_pro_12 + cluster_pro_13 + cluster_pro_14 + cluster_pro_15 + cluster_pro_16 + cluster_pro_17 + cluster_pro_18 + cluster_pro_19 + cluster_pro_20 + cluster_pro_21+ cluster_pro_22 + cluster_pro_23 + cluster_pro_24 + cluster_pro_25 + cluster_pro_26 + cluster_pro_27 + cluster_pro_28 + cluster_pro_29, data=datas)

summary(res)
ggforest(res, datas)
junjian Li
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R语言生存分析之COX比例风险模型构建及亚组森林图绘制示例
statistics+insight+vista+power
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R语言生存分析之COX比例风险模型构建及亚组森林图绘制示例
R语言生存分析：Cox回归
医学和生信笔记的博客
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上次介绍了生存分析中的寿命表、K-M曲线、logrank检验、最佳切点的寻找等，本次主要介绍Cox回归。本推文不涉及理论，只有实操，想要了解生存分析的理论的请自行学习。
R 回归 虚拟变量na_R语言 | 生存分析之R包survival的单变量和多变量Cox回归
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（生物信息学）R语言与统计学入门（十）—— 多因素Cox回归分析
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上次提到单因素cox回归分析： （生物信息学）R语言与统计学入门（九）—— 单因素cox回归分析_Lijingxian教你学生信的博客-CSDN博客_r语言单因素回归分析​COX回归模型，又称“比例风险回归模型(proportional hazards model，简称Cox模型)”，是由英国统计学家D.R.Cox(1972)年提出的一种半参数回归模型。该模型以生存结局和生存时间为因变量，可同时分析众多因素对生存期的影响，能分析带有截尾生存时间的资料，且不要求估计资料的生存分布类型。由于上述优良性质，该模
分类，等级，或者有序变量如何进行多因素Cox回归 变量的类型决定了最终结果的reference
生信小博士的博客
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这类变量可以进行等级划分，进行排序比较，比如喜欢的程度可以分为高中低，高中的年级可以是高一、高二、高三，学历可以分为小学、中学、高中、大学、研究生等。这也是定性变量的一个性质。解决办法是在准备cox分析输入文件时，不要把tumor stage 按照 1，2，3，4粗暴的进行赋值，这样会触发r包的识别机制，r包会很自然的把tumor stage按照连续变量进行计算。之前，根据某自学网的课程进行Cox分析的学习，自打那时起，我就把Cox分析的准备文件全部整理成连续变量。这样就可以愉快的发文章啦！
R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包) 森林图 cox可视化
生信小博士的博客
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计划是介绍一下单因素、多因素、亚组分析、其他类型森林图绘制；列线图部分介绍下基本的变量筛选方法、绘制过程、验证方法（ROC/DCA/校准图/分组比较等）、网页版列线图。其中，1.2是对表的修改，改完表，图就改了；3-5步是通过改字体、线宽等优化的。三-4、字体大小增粗、线条粗细、线型（包括置信区间）、行间距、列间距；三-3、加水平线、垂直辅助线、x周标签、大标题、森林图占比；三-5、颜色、HR方块形状等。三-2、显示所有亚组的患者数。三-1、显示所有变量；三-2、加入患者数目；三-1、显示所有变量。
R语言绘制SCI科研离散变量生存曲线源代码.zip
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本资源"R语言绘制SCI科研离散变量生存曲线源代码.zip"提供了一个方便的模板，帮助有R语言基础的研究者快速绘制离散变量的生存曲线，以便于发表在科学期刊（SCI）上。 首先，我们需要了解什么是离散变量。离散变量是...
R语言绘制SCI科研多指标生存ROC曲线源代码.zip
05-01
本资料“R语言绘制SCI科研多指标生存ROC曲线源代码.zip”提供了绘制生存ROC曲线的解决方案，尤其适用于已有R语言基础的研究人员。 生存ROC曲线是基于时间依赖的ROC曲线，它考虑了随时间变化的预测效果，这对于评价...
变量转换回归方程计算其相关指数.rar_VBScript_
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本教程将详细介绍如何利用R语言对癌症数据集进行生存分析。 生存分析的核心概念是生存时间（Survival Time），通常表示为从研究开始到某个事件发生的时间，比如癌症患者的存活时间。在R中，`survival`包是进行生存...
R语言 所有分类数据回归
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《医学分析实例教程》是一本全面讲解如何使用R语言进行医学数据分析的实战指南。它包含了丰富的源代码、实际数据集以及详细的案例分析，旨在帮助读者深入理解和应用R语言在医学统计分析中的各种方法。 首先，我们要...
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从TCGA上下载数据库和临床数据之后，往往需要进行COX分析，一般的分析思路是先进行单变量，在进行多变量的分析。然而，当关注的基因比较多是，手动输入就会比较麻烦。接下来介绍一种利用循环的方法，快速的对多个变量进行分析。 首先是导入数据，包括基因表达counts数据和临床数据sur，autophage是我下的一个自噬基因集，可根据需要替换为其他需要分析的基因列表，以及要用到的包： setwd("D:/A1/Rdata/Autophage/胰腺癌") library("survival") library
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