定义ROI的几种方法

一、使用spm中的wfupickatlas工具

该工具里有很多脑模板,选取ROI可以在里面选择后保存为mask。这个方法是在标准模板(MNI)下直接标记而做的,这里把wfupickatlas工具包【提取码:a6bi】放进来吧。

使用方法:

将压缩包解压后放入到spm路径下的toolbox目录里,然后在MATLAB中添加路径即可。然后在spm里的toolbox下选择wfupickatlas选择你要定义的ROI就行了。

二、使用fsl对单个被试分割

fsl里面分割roi的方法大概有fslmaths、first、fsleyes这三种方法,具体方法YouTube上都有就不详细说了。

三、使用MarsBar进行定义ROI

MarsBar工具包之前的文章里有,MarsBar与spm的wfupickatlas还是有一些区别的,这里说下主要的区别吧,MarsBar不仅可以定义sphere,box,还能设置box的设置方法。比如根据xyz的坐标范围来定(对之后壳核的分割方法有用)。

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