R绘图(7): 把散点图的点换成扇形

最新推荐文章于 2023-12-20 09:06:17 发布

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分类专栏：绘图

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/118999989

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前几天分析了一批单细胞TCR的数据，需要画这样一个图：

行是不同的样本，列是不同的T细胞类型，每一个位置点的大小表示T细胞的数目多少，并且还需要根据T细胞所属的克隆型类型涂色。这个图用来描述TCR是我自己构思的，之前没有在文章中见过。好在画图工具是现成的，用的是余老师的scatterpie包。后台回复20210722即可获取本文的测试数据。

1. 导入测试数据

library(tidyverse)
library(scatterpie)
library(reshape2)

df1=read.table("test.txt",header = T,row.names = 1,sep = "\t",stringsAsFactors = F)

看一下数据格式

> head(df1)
sample celltype clonal_expansion
TTAGTTCGTTCGGCAC tumor5        E                1
ATAACGCGTGAGGCTA tumor5        A        morethan3
CTCTAATCAACACCTA tumor1        B                1
AGACGTTAGTGTGGCA tumor5        A                1
AGATCTGTCACGGTTA tumor5        C                1
TCAGCTCTCGGCGCAT tumor3        A                1

> table(df1$samp