Ubuntu 18.04安装FSL软件

Ubuntu18.04安装FSL软件

最近刚刚下载了Ubuntu18.04，发现界面变化很大，第一眼当然是用户登陆界面，有点像是windows的风格，不过很好看。登陆之后，发现页面关闭的X在右上角，不是很习惯，有想试试的，可以戳这里下载：
Ubuntu18.04下载.
本文主要介绍磁共振处理软件FSL的安装过程。这里是该软件的英文介绍以及相关安装使用方法：FSL_Wiki.

安装过程

此次用到的Ubuntu18.04是在VM虚拟机里运行，是全新安装，在安装FSL遇到很多问题，以下为具体安装过程：

• 首先建议对Ubuntu的源做个修改，因为在更新时候，国外的一些源无法下载，会导致后续的一些环节无法进行，具体方法如下：
  • 建议切换到root帐户（要求输入密码）：

  sudo su
  

  • 备份原来的源：

  cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources_init.list
  

  • 更换源：

  gedit /etc/apt/sources.list
  

  • 将下面给出的源（清华）复制到sources.list中：

  deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial main restricted universe multiverse
  deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-updates main restricted universe multiverse
  deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-updates main restricted universe multiverse
  deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse
  deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse
  deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-security main restricted universe multiverse
  deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ xenial-security main restricted universe multiverse
  

  • 更新源：

  apt-get update
  

  • 卸载出错的安装包，重新安装正确的：

  apt-get -f install
  

  • 更新软件包（过程比较久）:

  apt-get upgrade
  

• FSL安装
  • 打开官网链接：FSL.
  • 显示如下界面，选择对应的Ubuntu18.04以及清华的镜像：
    
  • 在终端输入如下指令：

  wget -O- http://neuro.debian.net/lists/bionic.cn-bj1.libre | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
  apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pool.sks-keyservers.net:80 0xA5D32F012649A5A9
  

  • 再一次更新：

  apt-get update
  

  • 安装FSL，官网给出的指令无法正确安装，使用如下指令：

  apt-get install fsl
  

  • 若安装时出现错误如：
    ** E：Package has no installation candidate**
  • 使用以下指令之后，再次安装：

  apt-get update
  apt-get upgrade
  

• 配置环境变量
  • 在文件系统查找可执行文件fsl，找到其路径：
    
  • 修改环境变量文件，执行：

  gedit /etc/bash.bashrc
  

  • 以下语句加入文件结尾：

  . /etc/fsl/fsl.sh
  

  • 保存，关闭文件。到这里FSL就安装完成了。
• 测试是否安装完成
  • 可以新打开一个终端，输入fsl，出现以下界面，说明安装成功：
    

至此，在Ubuntu18.04上安装FSL就成功了：）