物种组成
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EcoEvoPhylo
Research Interest: Microbial Metagenomics; Fish Genomics and Genetics; Evolutional Genetics; Bioinformatics
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R统计绘图 | 物种组成堆叠面积图(绝对/相对丰度,ggalluvial)
数据使用的不同处理土壤样品的微生物组成数据,包含物种丰度,分类单元和样本分组数据。此数据为虚构,可用于练习,请不要作他用。数据表和代码可从QQ交流群文件夹中下载,或EcoEvoPhylo公众号后台发送“Stackarea_map”获取。图3|按门汇总的各处理物种丰度均值数据,phy。图1|物种丰度及分类单元注释信息,spetax.csv。图5|按门汇总的各处理物种相对丰度数据,rel_phy。图4|绝对丰度堆叠面积图,abs_area.pdf。图6|相对丰度堆叠面积图,rel_area.pdf。原创 2023-02-23 18:54:55 · 1125 阅读 · 1 评论 -
R统计绘图 | 物种组成冲积图(绝对/相对丰度,ggalluvial)
数据使用的不同处理土壤样品的微生物组成数据,包含物种丰度,分类单元和样本分组数据。此数据为虚构,可用于练习,请不要作他用。图3|按门汇总的各处理物种丰度均值数据,phy。包在门水平绘制物种组成冲积图,可以绘制绝对丰度冲积图,也可以使用相对丰度绘制冲积图。图1|物种丰度及分类单元注释信息,spetax.csv。图5|按门汇总的各处理物种相对丰度数据,rel_phy。图4|绝对丰度冲积图,abs_allu.pdf。图6|相对丰度冲积图,rel_allu.pdf。图2|样本分组信息,group.csv。原创 2023-02-23 18:24:53 · 1660 阅读 · 0 评论 -
R统计绘图 | 物种组成堆叠柱形图(绝对/相对丰度)
数据使用的不同处理土壤样品的微生物组成数据,包含物种丰度,分类单元和样本分组数据。此数据为虚构,可用于练习,请不要作他用。图1|物种丰度及分类单元注释信息,spetax.csv。图2|样本分组信息,group.csv。原创 2023-02-23 18:12:32 · 4982 阅读 · 4 评论