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EcoEvoPhylo
Research Interest: Microbial Metagenomics; Fish Genomics and Genetics; Evolutional Genetics; Bioinformatics
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R统计绘图-多变量单因素非参数差异检验及添加显著性标记图
一、 数据准备数据包括36个样本,4个处理,7个环境因子,研究目的是为了比较处理间每个环境因子是否存在差异。# 1.1 设置工作路径setwd("D:\\EnvStat\\stat")getwd()#获取工作路径# 1.2 导入数据env = read.csv("env.csv",header = TRUE,row.names = 1,stringsAsFactors = FALSE)dim(env)head(env) # 第一列为分组信息,2-8列为环境因子数据图1|环境原创 2022-04-27 22:11:35 · 1307 阅读 · 0 评论 -
R统计绘图-One-Way MANOVA
存在两个及以上连续结果(或响应)变量的ANOVA被称为多变量方差分析(Multivariate Analysis of Variance,MANOVA)。例如,将小鼠分为处理A和处理B两组后,测量小鼠的长度和高度。此时小鼠的长度和高度就是结果变量,假设长度和高度都因为处理不同产生差异。此时可以使用MANOVA检测上述假设。MANOVA分析过程总结如下:1)将所有结果变量经过线性组合形成一个新的复合变量;2)比较新变量在分类变量中的均值。本文接下来描述在R中如何进行MANOVA。一、原创 2021-09-09 10:23:57 · 2646 阅读 · 1 评论