snakemake 在slurm 系统上提交任务的方法

snakemake 在slurm 系统上提交任务的方法

#!/bin/bash
#SBATCH -J smk.t
#SBATCH -N 1            # 节点数
#SBATCH -n 4            # 进程数
#SBATCH -c 1            # 线程数
#SBATCH --mem=16g        # 内存，int
#SBATCH -p hfacexclu02,hfacexclu03,hfacexclu06   #whichpartition查看队列名称

date
# source /public/home/bgiadmin/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate snake
cd /public/home/bgiadmin/Project/
snakemake -s 01.filter.smk -j 4
date