在使用 Stereopy 库进行空间转录组学数据分析。在 Stereopy 中,data.tl.highly_variable_genes
是 StPipeline
类的一个方法,用于标记数据中的高变异基因。
要查看已标记的高变异基因,您可以按照以下步骤进行:
-
调用
highly_variable_genes
方法:
首先,您需要运行该方法来标记高变异基因。data.tl.highly_variable_genes()
这将根据默认参数标记高变异基因。您也可以根据需要调整参数,例如设置
n_top_genes
来指定选择的高变异基因数量。 -
查看标记结果:
标记完成后,结果将存储在data.tl.result
中,键名为'highly_varia