图神经网络的池化操作

图神经网络有两个层面的任务:一个是图层面(graph-level),一个是节点(node-level)层面,图层面任务就是对整个图进行分类或者回归(比如分子分类),节点层面就是对图中的节点进行分类回归(交通网络道路流量预测)。对于图层面的任务,我们需要聚合图的全局信息(包括所有节点和所有边),并且聚合全局信息得到一个可以表示全图的向量,后续对该向量进行分类回归操作。

如何将全局信息表示为一个向量呢,在图片分类和回归任务中,我们有池化操作,在图数据中,我们一样引入池化操作。

目录

1、全局池化

1.1 readout

1.2 全局虚拟节点

2、层次池化

2.1 基于图坍缩的池化机制

2.2 基于TopK的池化机制

2.3 基于边收缩的池化机制

参考文献

 

1、全局池化

1.1 readout

读出操作(readout)[1]最简单的池化操作,其操作公式为:

\mathbf{y}=R({\mathbf{h}{_{i}}^{(k)}|\forall v_{i}\in V})

其中R可以是max,sum,mean操作,也就是说readout直接对图中所有节点求最大值,求和,求均值,将做得到的值作为图的输出。

1.2 全局虚拟节点

全局虚拟节点[2]就是引入一个虚拟节点,这个虚拟节点和图中所有节点相连,并且也参加整个图的卷积等操作,最后该虚拟节点的隐含特征就是整个图的特征,示意图如下:

引入全局节点e_{0},图中原来的节点为e_{1},e_{2},e_{3}

2、层次池化

层次池化经过K轮消息传递,节点更能够提取全局信息。

2.1 基于图坍缩的池化机制

图坍缩就是将图中的节点划分为几个节点簇,每个节点簇作为下一次图坍缩的节点。

目前DIFFOOL[3]和EigenPooL[4]是两种基于图坍缩的图神经网络算法

2.2 基于TopK的池化机制

TopK[5]对池化机制和上面的图坍缩不同,图坍缩是将图的节点不断聚合成簇的过程,而TopK是一个不断抛弃节点的过程,具体来说就是设置一个超参数k,其中k\in (0,1),接着学习出表示节点重要度的值z并按照重要度对节点进行降序排序,选择最重要的kN个节点,公式表示如下:

i=top\_rank(z,kN)

X{'}=X_{i,:}

A{'}=A_{i,j}

X{'},A{'}表示一个切片操作,就是留下kN个节点以及与其相连的边

如何选择z也是一个可以创新的地方,在论文中,作者引入了一个全局基向量p,将节点向量在该向量上的投影作为重要度:

z=\frac{Xp}{\left \| p \right \|}

其中X为节点特征向量。论文中给出的TopK的模型结构为:

该作者还在每一层池化之后添加读出操作,并在最后最后一层做求和,这样有助于虽有节点的信息融合。

2.3 基于边收缩的池化机制

该方法迭代式的对每一条边的节点进行两两归并并形成新的节点,同时保留合并前的两节点的连接关系到新节点上,EdgePool[6]就是基于边收缩的池化图网络,接下来介绍其相关算法:

首先对于每条边计算一个原始分数:

r_{ij}={\mathbf{w}}^{T}[h_{i}||h_{j}]+b

如下图(左)根据A,B,C,D四个点计算出来的边的原始分数

再根据入度计算每个边的分数:

r_{i}=e^{r_{ij}}

节点分数为边入度边分数之和

如下图(左中),D的值就是:e^{0.5}=1.6, C的值为e^{0.5}+e^1+e^3=1.6+2.7+20=24.5

再计算边对其入度节点的值的归一化

如下图(右中),C->D的边的值为:1.6/1.5=1

最后选择分数最大且未被选中的两个节点进行收缩操作。

 

收缩之后的节点更新方式为:

h_{ij}=s(h_i+h_j)

s可以为求和,求均值,全连接等操作。


参考文献

[1] Gilmer J, Schoenholz S S, Riley P F, et al. Neural message passing for quantum chemistry[J]. arXiv preprint arXiv:1704.01212, 2017.

[2] Pham T, Tran T, Dam H, et al. Graph classification via deep learning with virtual nodes[J]. arXiv preprint arXiv:1708.04357, 2017.

[3] Ying Z, You J, Morris C, et al. Hierarchical graph representation learning with differentiable pooling[C]//Advances in neural information processing systems. 2018: 4800-4810.

[4] Ma Y, Wang S, Aggarwal C C, et al. Graph convolutional networks with eigenpooling[C]//Proceedings of the 25th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery & Data Mining. 2019: 723-731.

[5] Cangea C, Veličković P, Jovanović N, et al. Towards sparse hierarchical graph classifiers[J]. arXiv preprint arXiv:1811.01287, 2018.

[6] Diehl F. Edge contraction pooling for graph neural networks[J]. arXiv preprint arXiv:1905.10990, 2019.

[7] 刘忠雨,李彦霖,周洋,《深入浅出图神经网络:GNN原理解析》

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