复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellchat、cellphonedb)

之前微信群发布了一个图希望我们复现,是一篇science子刊的文章。展示的是细胞通讯的受配体对的表达情况。特点是受配体配对连线并展示了表达量。

Singlecell RNA sequencing highlights intratumor heterogeneity and intercellular network featured in adamantinomatous craniopharyngioma

原文的方法部分描述如下,可以看出,作者展示的是cellchat结果的受配体对。但是我想cellphonedb的结果也是可以这样展示的。  

复现这个还是花费了一番功夫,复现结果如下,结果最后需要用AI稍微排版一下,效果就更完美了。

学习这一节的内容,其实不仅仅是这个图的复现,还是对ggplot2作图各种情况的处理,以及学习拼图。学习的时候也可以注意这些细节。

详情请至我们的公众号---KS科研分享与服务

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值