Dicom批量转换为Nifti格式的github小工具使用（命令行方式）

医学图像格式转换（DICOM -> NIFTI）
Dicom是一个医学图像标准，不一定是具体的文件后缀，如医院原始的CT和MRI数据并无后缀（图示为核磁数据）。

该文件夹下有多张图像，神经网络处理方式通常为标准的(.nii.gz)压缩格式，即将该文件夹下多个图像合成一个文件。

方法和工具：
Github链接: link.
安装方法：（如果有conda,建议使用如下方法，省事）
打开命令行（cmd)，激活自己的环境（activate 你自己的环境名称)

conda install -c conda-forge dcm2niix

查看帮助

具体使用：（windows环境下）

dcm2niix -z y -f myMRI%s -o "F:\AIStudio" "F:\AIStudio\2021核磁\11"

代码说明：
其中 -z y 是指定的nii.gz后缀
-f ****%s ***号代表指定名字
-o “mypath” 是输出路径，是字母o(output)，路径使用双引号
最后一个路径是文件所在路径，同样使用双引号

压缩后的结果

此时可使用ITK-Snap等软件查看

该Github链接有release版本，但是我的两台window机器打不开该软件，故使用工具的命令行方式进行测试，记录一下使用流程。