RNA-seq 比对软件STAR——(1)安装
一、package下载
在GitHub知道package,使用加速复制链接下载。我需要2.7版本以上,所以下载最新版,建议没有特定需求下载最新版,bug修复的差不多了,更便捷
#直接gitclone
git clone https://github.91chi.fun/https://github.com/alexdobin/STAR.git
#或者wget
wget https://github.91chi.fun/https://github.com//alexdobin/STAR/archive/refs/tags/2.7.10a.tar.gz
二、编译
tar zxvf 2.7.10a.tar.gz
cd STAR-2.7.10a
cd source
make STAR
三、环境配置
修改环境 vim ~/.bashrc
增加下面一行后source ~/.bashrc
export PATH="/share2/pub/yangjy/yangjy/softs/STAR-2.7.10a/bin/Linux_x86_64_static:"$PATH
注意:一定是bin目录下的linux_x86_64_static 不是linux_x86_64!! 如果写错了就会出现下图的情形
四、测试
STAR --version
OK 啦