nii 文件的相关操作（SimpleITK）

目录

0. 介绍

1. nii 文件

2. nii 文件读取 demo

2.1 图像的读取

2.2 nii label 图像的读取

2.3 可视化

3. slice 对nii 文件的切片

4. 数据的堆叠

4.1 重新排序

4.2 堆叠

5. 测试代码

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0. 介绍

如图：image 存放的是原始的nii数据，label是nii对应的label图像

demo 是对nii的读取和显示

slice 是将多通道的nii进行切片，保存到 jpg 文件

stack 是对 jpg 文件的堆叠

1. nii 文件

 .nii文件是NIFTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）：神经影像信息学技术倡议

Nifti数据本身是除了矩阵信息（也就是图像信息之外），还有和物理坐标相关的仿射矩阵以及Header头文件信息.

这里用 SimpleITK（SimpleITK是专门处理医学影像的软件） 进行读取，SimpleITK 的安装

pip install SimpleITK

导入SimpleITK用如下的方式

import SimpleITK as sitk

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