.nii格式文件解析

一、nii格式文件具体内容

nii格式（NIFTI格式的扩展）是为多维神经影像学发明的，可真实反映元数据，包含方向信息。nii格式图片主要包含三部分信息：hdr, ext, img（其中.hdr和.img也可用单文件.nii存储）

1、hdr（header数据头）

同一版本的nii文件的数据长度是固定的。header里包含的信息有：

• 维度：x,y,z,单位为毫米（有可能出现第四个维度---时间）
• 体素（voxel size）大小：毫米单位的x,y,z大小(体素就是固定分辨率的三维栅格地图，可类比为二维图像中的像素)
• 数据类型：一般为int16，最好用double类型
• Form和转换矩阵：每个Form对应一个转换矩阵，转换矩阵可以轻松分清图像的左右，可将体素索引（i,j,k）矩阵转换为空间位置（x,y,z）

2、ext（extension）

是可以自己随意定义数据的部分，可以自己使用

3、img（image）

用于存储3D或者4D的图像数据

二、nii格式与dicom格式的区别

nii格式和dicom分别为两种医学影像数据的格式，它们分别定义了不同的方向：

 

三、nii文件的打开方法

.nii文件可用ITK-SNAP软件直接读取：

ITK-SNAP下载地址：ITK-SNAP Version 3.x Downloads

读取结果如下：

以上三个框分解展示了 扫描到的牙齿的三个角度的视图（水平面、矢状面、冠状面）

更具体的文章大家可参考：python 笔记：打开nii格式（nibabel 库）_大数据_UQI-LIUWJ-DevPress官方社区 (csdn.net)