安装Hisat2

一、（MobaXterm_Personal）安装aspera

首先进行预编译解压安装：

mkdir Biosofts
unzip hisat2-2.2.1-Linux_x86_64.zip -d ~/Biosofts/
cd ~/Biosofts
ll
###zip文件，unzip解压，-d制指定目录

 安装完成：

 设置环境变量：

echo 'export PATH=~/hisat2-2.2.1:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
##~/.bashrc文件加环境变量，source生效环境变量

第二，源码安装：

cp /disk1/shares/hisat2-2.2.0-source.zip ./
unzip hisat2-2.2.0-source.zip
cd hisat2-2.2.0
make
##用户没有对shares的权限，cp到~目录下解压

二、centos系统下安装hisat2

hisat2下载网址：

wget ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip

预编译安装同上，源码安装下载hisat2源码

root权限下yum安装：

暂时还未解决