使用schrodinger建立深度学习QSAR模型

使用schrodinger建立QSAR模型

本篇教程将展示如何使用AutoQSAR/DeepChem去设定,建立和理解深度学习QSAR/QSPR模型.

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一、深度学习QSAR模型是什么？

定量构效关系（QSAR）指的是利用数理统计方法建立特定性质与分子的理化性质参数或结构参数之间关系的方法,而深度学习则是数理统计方法中的最为强大的方法之一.深度学习QSAR模型的主要优势在于完全由数据驱动,当数据量越大,模型的能力就越强.

二、使用步骤

文件名显示为如右格式:1fjs.pdb
需要点击或输入则显示为如右格式:File > Import Structures

1.创立项目引入结构

2.建立一个AutoQSAR/DeepChem 模型以预测污染物致突变性.

3.分析和使用AutoQSAR/DeepChem 污染物致突变性模型

3.1 分析

3.2 使用

4.分析来自AutoQSAR / Deepchem模型的Ames致突变性的预测结果

4.1 确定分类阈值

4.2 预处理数据做混淆矩阵分析

4.3 混淆矩阵分析