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RSS订阅原创 肿瘤微生态研究利器——5R 16S rDNA测序
肿瘤微生物组（Tumor Microbiome）是肿瘤微环境中不可或缺的成员，肿瘤内微生物群通过多种机制影响肿瘤发展，在不同类型的肿瘤中，肿瘤内微生物群的组成和丰度具有高度异质性。由于它们的低生物量和其他障碍，全面描述肿瘤微生物组的特征极具挑战性。目前可用于研究肿瘤内微生物群的技术有。是对16S rDNA基因上的五个区域（V2、V3、V5、V6、V8）进行多重PCR扩增和测序。可有效降低组织中宿主DNA对细菌16S rDNA扩增的严重干扰。技术特点灵敏度更高分辨率更高，可用于种水平鉴定。
2024-07-17 12:01:16
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原创 Nature子刊|超千份宏病毒组样本，告诉你如何送样
粪便免疫化学测试（FIT）是筛查结直肠癌的主要手段，直接利用FIT样本进行宏病毒组测序是否可行？
2024-07-15 10:21:05
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原创 项目文章｜Cell子刊One Earth 土壤微生物多样性与人畜致病菌的流行
农田土壤孕育了大量微生物，其中也包括对人类和动物造成威胁的条件致病菌。
2024-07-10 10:43:26
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原创 客户文章|肠道微生物群在强迫症发病中的关键作用：琥珀酸信号揭示新机制
该研究通过将强迫症患者的粪便微生物群移植至小鼠体内，诱导小鼠出现强迫症行为，改变了其肠道微生物群，并发现琥珀酸参与了强迫症的发病机制。
2024-07-05 11:40:15
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原创 揭秘微生物社区的“社交网络”：基因组规模代谢模型(GEMs)的新前沿
当前，微生物群落的基因组组成和功能潜力通过宏基因组组装基因组（MAGs）的分析得以部分揭示，但其内在的代谢网络和相互作用机制仍充满未知。
2024-06-26 10:46:23
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原创 Nature Microbiology丨VITA单细菌转录组测序技术助力深入解析奶牛瘤胃微生物组功能异质性
瘤胃微生物组一直以来都是研究相对不足但又极其复杂的微生物生态系统之一。
2024-06-17 16:12:39
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原创 Nature子刊：你的健康在出生就被肠道病毒定义了？
ELGV目录提供了早期人类肠道病毒组最全面和完整病毒数据蓝图，这将有助于未来发现儿童疾病与病毒组之间的关联。
2024-06-14 10:56:28
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原创 构建全面框架 | 简化基因组+线粒体遗传进化联合分析
该研究旨在构建一个全面的框架，以界定和识别全球性害虫——烟粉虱（Bemisia tabaci）隐种复合体内的物种。
2024-06-13 16:24:43
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原创 Microbiome | binning+转录组→首个草鱼肠道基因集目录发布啦
此研究，不仅揭示了草鱼肠道微生物群的奥秘，也为水产养殖业的绿色发展提供了新的思路。
2024-06-07 10:55:58
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原创 不服就干！FEAST微生物溯源：一场微生物“寻根究底”的浪漫之旅
解样本中这些生物体来自何处以及如何形成群落，探清微生物的源头对于理解微生物群落构建机制、优先效应以及生物安全是很必要的。
2024-06-05 15:43:21
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原创 客户文章Microbiome | 破解植物-昆虫-共生体系微生态
本研究首次揭示了家蚕通过食用桑叶，从而在其表皮上累积抗真菌细菌的机制，强调了跨界微生物转移在昆虫防御系统中的作用
2024-06-04 11:44:04
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原创 IF=82.9|肠道病毒组新发现：病毒可与宿主免疫系统直接互作
发现患哮喘风险受到宿主 TLR9 rs187084 基因变异的调节，表明噬菌体与宿主免疫系统之间存在直接相互作用。
2024-05-30 17:27:06
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原创 Nature plants|做完单细胞还可以做哪些下游验证实验
富含共生固氮基因的基因模块表明，MtFER和LYK3对共生信号具有相似的反应。进一步发现MtFER可以被LYK3磷酸化并参与根瘤菌共生。
2024-05-28 14:49:36
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原创 植物单细胞测序如何做marker基因识别及后续验证？
通过比较原形成层和维管形成层的特定转录组数据有助于研究多年生植物从初生到次生生长的过渡过程。
2024-05-24 14:29:20
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原创 ISME子刊|扩增子+宏基因组binning助力西藏湖泊甲烷氧化细菌研究
湖泊沉积物中的甲烷氧化微生物受到盐度的影响，并在这些湖泊的甲烷循环中发挥着重要作用。
2024-05-23 11:50:58
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原创 产品升级|宏病毒组：为啥别人未知病毒质量这么高？？
宏病毒组的研究做了这么多，从宏基因组分析结果中鉴定得到数百万个新病毒序列，我们发现这些病毒序列（vOTUs）的质量和完整性参差不齐。
2024-05-21 16:00:32
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原创 实验室无法培养的菌，原来可以这么研究！
研究通过PacBio HiFi测序获得anammox细菌群落的全基因组信息，揭示其多样性、功能特性和适应性进化机制，为进一步研究anammox细菌的生态角色和生物技术应用提供理论依据。
2024-05-15 15:36:17
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原创 Nat Plants | 植物抽核单细胞！多组学探究大豆根瘤成熟过程
本研究获取的实验数据为在单细胞分辨率下进一步研究根瘤成熟的调控网络提供了新见解。
2024-05-14 15:09:17
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原创 Nature子刊：常见口服药的副作用原来这么大!
本研究通过高通量原核转录组学方法，系统分析了常用口服药物对常见人类肠菌基因表达的影响，涉及409个药物-肠菌配对，为理解药物介导的菌群改变提供了机制性见解和研究资源
2024-05-11 18:25:53
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原创 IF：23.2｜从实验室到田间，微生物干预提高植物抗逆
本研究介绍了一种名为SynCom的微生物组合，该组合Rhodococcus erythropolis和Pseudomonas aeruginosa两种微生物组成
2024-05-10 17:32:35
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原创 snRNA-seq vs scRNA-seq谁更nice，用数据说话
snRNA、scRNA傻傻分不清的时候，人家已经开始择优了，如今的单细胞有当年高通量测序之势，势不可挡
2024-05-06 10:33:38
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原创 IF 27.5|GWAS+图位克隆法，揭秘水稻调控籽粒性状的关键基因
水稻是全球种植最广泛的作物，拥有超过12万个品种，提高粮食品质是当代水稻育种的首要目标
2024-04-28 11:43:39
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