生物化学-第两章半-肽和蛋白质

目录

一、肽和肽键

命名及书写方式

肽键的双键性质

二、蛋白质分类

（一）按照蛋白质的组成，分为：

（二）、蛋白质分子的形状和大小

三、蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次

蛋白质结构的组织层次

四、蛋白质功能的多样性

五、蛋白质一级结构的测定

蛋白质一级结构的测定

（1）测定蛋白质的一级结构的要求

（2）测定步骤

六、蛋白质的氨基酸序列与生物进化

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一、肽和肽键

肽是氨基酸的线性聚合物，因此也称为肽链（peptide chain）。

一个氨基酸的α-氨基与另一个氨基酸的α-羧基之间失水形成的酰胺键称为肽键，所形成的化合物为肽。

蛋白质是由一条或多条具有确定的氨基酸序列的多肽链构成的大分子。

由两个氨基酸组成的肽叫做二肽，由多个氨基酸组成的肽叫多肽。组成多肽的氨基酸单元叫做氨基酸残基。

• 二肽 tripeptide ，由两个AA组成的肽称为二肽。
• 三肽 tetrapeptides, 
• 四肽 pentapeptides,
• 寡肽 Oligopeptide （12-20AA）
• 多肽Polypeptide，由多个AA组成的肽则称为多肽。
• molecular weight is less than 10 000（˂50AA）
• 蛋白质 protein(˃51AA)

组成多肽或蛋白质的AA单元称为氨基酸残基。

命名及书写方式

一条肽链通常含有一个游离的α-氨基酸（N-末端）和一个游离的α-羧基端（C-末端）。

规定肽链的氨基酸排列顺序从其N-末端开始，到C-末端终止。常把N-末端氨基酸残基放在左边，C-末端氨基酸残基放在右边。

小分子肽一般按照氨基酸残基的顺序进行命名，如：

Tyr-Gly-Gly-Phe-Met称为：酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙氨酰蛋氨酸（脑啡肽）

氨基酸的α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基缩水形成肽键。肽键是氨基酸分子中氨基酸连接的基本方式。肽键相连构成蛋白质的主链。

肽链的骨干是由-N-Cα-C-序列重复排列而成，称为共价主链(main chain or backbone)。

肽键的双键性质

• 肽键氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。组成肽键的原子属于同一平面。
• 
• 肽键C-N键具有部分双键性质，不能自由旋转。(肽酰基转移酶决定)。
• 大多数情况下，以反式结构存在。

肽键共振产生的几个重要结果：

• 限制了肽键的自由旋转，只有N-Cα和C α-C这两个键
• 的旋转，构成了肽平面(peptide plane)或酰胺平面(amide plane)。
• 键长具有部分双键的功能。肽键的反式构型

核糖体合成的多肽：

1、有其编码基因；

2、先以前体形式合成；

3、不含D-AA；

4、肽键由α-NH2和α -COOH形成

 e.g. 恶毒霉素(oxutocin)

非核糖体合成的多肽：

1、在系列酶作用下在核糖体以外形成；

2、可能含有D-AA；

3、肽键不一定由α -NH2和α -COOH形成

 e.g. 谷胱甘肽(glutathine）

二、蛋白质分类

蛋白质的化学组成和分类

• 碳：50%；氢：7%；氧：23%；氮：16%；硫：

0.3%；其他：微量。

• 凯氏（Kjedahl）定氮法：

 蛋白质含量=蛋白氮×6.25

（一）按照蛋白质的组成，分为：

1.简单蛋白（simple protein）：又称为单纯蛋白质；这类蛋白质只含有α-氨基酸组成的肽链，不含其他成分。

（1）清蛋白(albumin)和球蛋白 ( globulin) ：广泛存在于动物组织中。清蛋白易溶于水，球蛋白微溶于水，易溶于稀酸中。

（2）谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白(prolamin)：植物蛋白，不溶于水，易溶于稀酸、稀碱中，后者可溶于70－80％乙醇中。

（3）精蛋白和组蛋白：碱性蛋白质，存在与细胞核中。

（4）硬蛋白：存在于各种软骨、腱