CIRCOS教程翻译 1.3 ——染色体的变化

继续翻译,这一节是染色体的分割模式,两个次要配置文件没有变化(ticks和ideograms),主文件变化为:

karyotype = data/karyotype/karyotype.human.txt
chromosomes_units = 1000000

chromosomes_display_default = no #不让其显示默认的24条染色体
chromosomes                 = /hs[1-4]$/ #显示1到4号染色体

chromosomes_scale   = hs1=0.5r,/hs[234]/=0.5rn #1号染色体占图形一半的面积,2、3、4占剩下一半的面积然后平均分配

chromosomes_reverse = /hs[234]/ #将其ticks坐标反转显示

chromosomes_color   = hs1=red,hs2=orange,hs3=green,hs4=blue #设置染色体不同的颜色

<<include ideogram.conf>>

<<include ticks.conf>>

<image>
<<include etc/image.conf>>                
</image>

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>> 

<<include etc/housekeeping.conf>>


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