circos 可视化手册- zooms 篇

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在展示染色体信息时,如果想要重点展示其中某一段区域的信息,可以借助zooms来实现。zooms起到一个伸缩的功能,将原本的区域方法或者缩小。

配置文件写法如下:
在这里插入图片描述
zooms由多个zoom构成,每个zoom必须具备以下几个参数

  1. chr
  2. start
  3. end
  4. scale

其中chr, start , end这三个参数指定需要缩放的染色体区域,scale指定需要缩放的倍数。

看一个具体的例子:
在这里插入图片描述

在上面的示意图中,对染色体多处区域进行了缩放。其中对1号染色体上的部分区域进行了放大,对2号染色体上的部分区域进行了缩小。

1号染色体100-120Mb区域放大2倍,接下来的区域依次类推,分别放大了3倍, 4倍,5倍;对应配置文件的写法为

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