linux命令 For循环

要设定特定的循环列表，可以由文件导入，也可以由{} 导入。
比如要统计每个BAM文件里的reads数目，用for 循环可以如下：

for i in H3K4me1_{0,1,4,12}hour.bam;do echo $i; samtools view -c $i ;done

对从文件中提取：

for i in ${cat file.txt};do echo $i;done

对等差数列：

#有很多种用法
for i in {1..5};do echo $i;done
for i in {1..5..2};do echo $i;done   #等差
for i in $(seq 1 5);do echo $i;done
for i in $(seq 1 2 5);do echo $i;done

对从目录提取：

for i in `ls /`;do echo $i;done

通过脚本传参。参考：

echo "argument number are $#"
echo "the input is "

for argument in "$*";
do
    echo "$argument "
done

bash temp.sh 2 hellp good fine

输出：

argument number are 4
the input is 
2 hellp good fine