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PCA原理 statQuest
PCA concepts:PCA把所有细胞间(如果用基因表达来展示)的correlations在2-D图里表示。 PC1的差别远比PC2(PC3,PC4…)要大。 在这个例子中,倘若兰红距离和黄红距离一样,那么黄红之间的差别要比兰黄之间的差别大的多。PCA是dimension reduction中的一种,包括heatmap, t-SNE, Multi-Dimensional Sca...原创 2018-09-15 22:09:38 · 1373 阅读 · 0 评论 -
LDA原理 statQuest
在某些例子中,比如一个药物对哪些病人有效,哪些无效,我们可以尝试依据病人的基因表达来区分。我们可以选取一个或多个基因,但目的是要选取那些可以最大化提升区分这两组病人能力的基因。和PCA类似,但是PCA目的是提取variation最大的基因。LDA is like PCA, but it focuses on maxmizing seperatibility among known catego...原创 2018-09-13 16:20:45 · 274 阅读 · 0 评论 -
sklearn logistic regression学习
1. linear regressionlinear_model.LinearRegression()print(__doc__)# Code source: Jaques Grobler# License: BSD 3 clauseimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npfrom sklearn import d...原创 2019-07-04 14:51:33 · 952 阅读 · 0 评论 -
决策树学习
基于iris data画决策树的决策面For each pair of iris features, the decision tree learns decision boundaries made of combinations of simple thresholding rules inferred from the training samples. 选取一对特征,决策树会得到一系列...原创 2019-07-11 20:20:45 · 253 阅读 · 0 评论