arrayQualityMetrics
常用函数
1 aqm.writereport
功能:使用aqmReportModule
生成质量报告。
返回值:质量报告。
aqm.writereport(modules, arrayTable, reporttitle, outdir)
参数 | 注释 |
---|---|
modules | 含有 aqmReportModule 对象的列表。 |
arrayTable | 含有芯片metadata的data.frame。 |
reporttitle, outdir | 报告名称和输出的目录。 |
2 arrayQualityMetrics
功能:生成芯片质量报告。
返回值:芯片质量报告。
arrayQualityMetrics(expressionset,
outdir = reporttitle,
force = FALSE,
do.logtransform = FALSE,
intgroup = character(0),
grouprep,
spatial = TRUE,
reporttitle = paste("arrayQualityMetrics report for",
deparse(substitute(expressionset))),
...)
参数 | 注 |
---|