consensus sequence和sequence motif有什么有什么区别？关注者8被浏览6,181

consensus sequence 保守序列 可以应用在序列比对中，比如可以表示某个氨基酸或某几个氨基酸在进化中保守；

sequence motif 序列motif 是基于统计的一段序列，比如可以表示某个转录因子在基因组上面结合位点的序列。

Consensus sequence是事件（ATCG/amino acids)的集合或“maximum likelihood representation”

sequence motif 是对事件及其概率的建模

 

consensus sequence，既共有序列，是在一套相似序列中的每个位置上都由最常出现的残基所组成的DNA或氨基酸序列，决定启动序列的转录活性大小。sequence motif，既序列基序，可以定义为蛋白质（蛋白质序列）属于一个给定的蛋白质家族。

motif.png

consensus sequence更常见于启动子序列中，sequence motif更倾向于CDS区和蛋白质。