RDKit | 基于分子形状的比对

最新推荐文章于 2023-11-29 01:30:00 发布

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分类专栏： RDKit | 化学信息学与AI 文章标签：分子形状 RDKit Python 化学信息学生物信息学

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本文介绍了如何利用RDKit进行分子形状的比对，该技术在虚拟筛选和骨架跃迁中有重要应用。通过导入相关库，加载数据，调用Pymol进行可视化，并详细展示了比对和结果展示的步骤。

摘要由CSDN通过智能技术生成

基于分子形状的比对对于虚拟筛选和骨架跃迁都是非常有用的。

导入库

import os
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit import RDConfig
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import PyMol
from rdkit.Chem.Subshape import SubshapeBuilder, SubshapeAligner, SubshapeObjects

载入数据