高性能计算应用优化之IO调优

IO调优

IO是应用程序进行结果输出的主要方式，也是程序运行开销最大的部分。大规模并行程序通常需要多个处理器同时执行任务，处理大量的数据，处理器的速度日新月异，而IO操作的速度并没有同步提升，导致IO成为了程序运行的瓶颈。尤其在分布式环境中，IO操作更加复杂和耗时，对程序性能造成了严重影响。

因此，大规模并行程序中的IO操作已经成为了运行的最大瓶颈，需要采取相应的优化措施来减少IO操作对程序性能的影响。例如，采用异步IO、缓存、数据压缩等技术来提高IO操作的效率。

程序编写中IO的基本原则

在文件打开和关闭期间，需要遵循如下原则。首先，以正确的模式打开文件。如果文件仅用于读取，则必须以只读模式打开，因为选择正确的模式可以使系统应用优化并仅分配必要的资源。其次，不要过于频繁地打开和关闭文件，因为这涉及到许多系统调用操作。最好的方法是在第一次需要时打开文件，只有在足够长的时间内不需要使用时才关闭文件。最后，限制同时打开的文件的数量，因为对于每个打开的文件，系统必须分配和管理一些资源。

在文件读写期间，需要遵循如下原则。首先，在一个读写调用中写入/读取全部数组/数据结构，而不是每个元素进行一次读写操作。否则将会产生大量系统调用，对I/O性能产生负面影响。其次，避免多个进程打开同一个文件用于写入，在并行程序中，更常见的方法是依据MPI进程号为每个进程建立一个文件，每个进程分别读写其对应的文件。因为文件元数据的操作可能需要串行化的锁机制。最后，在MPI程序中可以使用非阻塞MPI I/O调用，或使用基于MPI-I/O的高级