在线作图|FAPROTAX数据库在线注释

最新推荐文章于 2024-05-13 00:12:56 发布

作图帮

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文章标签： big data r语言数据库

本文链接：https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/119996501

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本文介绍了FAPROTAX数据库在微生物多样性分析中的应用，特别是其在注释海洋湖泊生物化学过程和土壤微生物功能上的作用。同时，文章详细阐述了如何使用TUTU云工具进行FAPROTAX数据库的在线功能注释，包括数据上传、参数调整和结果下载，提供了一种便捷的在线分析方法。

摘要由CSDN通过智能技术生成

FAPROTAX数据库

在微生物多样性分析中，FAPROTAX数据库是常用的群落功能注释数据库。FAPROTAX数据库是Louca等人根据已发表的文献手动构建的数据库，目前收集自4600多个原核微生物的80多个功能分组7600多条功能注释信息，并且现在仍在持续更新。FAPROTAX数据库在注释海洋湖泊生物化学过程（硫、氮、氢和碳循环）中的功能、土壤微生物的功能等等应用较多且效果不错。
在这里插入图片描述

TUTU云工具使用

TUTUCLOUD网站提供在线实现FAPROTAX数据库功能注释的工具，并通过柱状图的形式展示其可视化成果。操作步骤如下：
①登录网址：https://www.cloudtutu.com/#/index（推荐使用360或者谷歌浏览器）
②输入用户名和密码（小编已经为大家填好了，如果不显示可添加文末二维码添加小编获取），输入验证码后即可登录，无需注册，直接使用，不必担心隐私泄露，是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏（全部分析）里找到FAPROTAX，点击进入；
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作。

Step 1：上传数据

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理，但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据，以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据，如微生物