在线作图|在线做扩增子抽平

本文介绍了如何使用在线工具TUTU云图图进行扩增子抽平处理,该平台按照样本最小总丰度进行抽平,适合用于alpha多样性、beta排序和距离分析。用户只需上传符合格式的.txt或.csv文件,无需注册,直接登录即可免费使用。处理后的OTU表可用于进一步的微生物分析。
摘要由CSDN通过智能技术生成

扩增子抽平

扩增子抽平工具主要是针对扩增子测序后得到的otu表进行抽平处理,本平台按照样本的最小总丰度进行抽平,过滤一些低丰度的OTU,抽平后得到的OTU表可以用来做alpha多样性分析、beta排序和距离分析。

TUTU云工具使用

小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(www.cloudtutu.com,免费的哦~),操作步骤如下:
①登录网址:https://www.cloudtutu.com/#/index(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录,不必注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在微生物分析工具一栏找到”扩增子抽平“,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作。

上传文件

※※※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传,最好传txt文本文件!
※※※请您务必按照示例数据的格式调整数据!上传文件中不可带有:中文、中文字符、空格、重复名称等!!!
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表等);
b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU、ASV等;
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(

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