linux下phylip软件构建NJ树,利用phylip软件对SNP数据构建进化树

1、下载、安装 phylip软件

wget http://evolution.gs.washington.edu/phylip/download/phylip-3.697.tar.gz

tar -xzvf phylip-3.697.tar.gz

cd phylip-3.697/

cd src/

make -f Makefile.unx install

安装成功的标志。

可执行程序在exe路径下：

2、下载测试数据 ，提取一小部分进行测试：

链接：https://pan.baidu.com/s/1VxgJK5asCEjukOeA1V5rlg

提取码：e69n

head -n 5 test.ped | cat - a && mv a test.ped