1.如何用MEGA和clustal建树?
https://wenku.baidu.com/view/b9674dc72f60ddccdb38a01f.html
2.MEGA7 构建 NJ 树
https://www.jianshu.com/p/ba470cfbfc3e?appinstall=0
3.Clustalw软件的使用(有在线版本)
https://wenku.baidu.com/view/59035788a1c7aa00b52acbc6.html
在线比对地址 : https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/
注:CLUSTALW是一种渐进的多序列比对方法,先将多个序列两两比对构建距离矩阵,反应序列之间两两关系;然后根据距离矩阵计算产生系统进化指导树,对关系密切的序列进行加权;然后从最紧密的两条序列开始,逐步引入临近的序列并不断重新构建比对,直到所有序列都被加入为止。
总的来说,就是先对序列进行比对,再建树。这个是把原始序列输入MEGA,怎么把距离矩阵导入MEGA,再进行建树,之后会说。