r语言热图对列不进行聚类_微生物群落文章中的热图都有哪些神奇操作？

当前微生物群落研究文章中，热图几乎成为了标配，在物种组成、多样性、功能预测、环境因子等分析内容中都有它的身影，并且样式非常多变。了解它们并用好它们对我们发表高分文章大有益处。这里为大家介绍一些这种图形的独特的分析及绘图参数。

热图（HeatMap）是一类由若干个小正方形方格组成的图形，以微生物群落研究中的物种丰度热图为例（如图1），横轴一般为分组/样本信息，纵轴每行都是一个物种，通过方格颜色比较分组间物种的丰度差异，颜色越趋近红色表示对应分组/样本该物种的丰度越高。

图1物种丰度热图

归一化（Normalization）参数

热图的基本展示单位是每个小格，当我们需要展示的数据间存在较大差异时经常出现数据差异被掩盖的现象。

如图2所示，数据表格中包含四个物种的丰度信息用于绘制热图，当直接采用原始数据进行绘制图形时，由于第一个物种的丰度值远大于其他物种，因此在图上除了第一个物种外，其他