go语言csv包_GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算

d40f7e23e6cf9ed385553fe716b28681.png

前面我们简单介绍过ggplot2画KEGG富集柱形图,其实GO富集结果的展示相对于KEGG来说要复杂一点点,因为GO又进一步可以划分成三个类。

BP:biological process,生物学过程。

MF:molecular function,分子功能。

CC:cellular component, 细胞成分。

因此在画图的时候,我们需要将这三类给区分开来。下面分别用了三种不同的方式来展示GO富集分析的结果。

64b73494c2142b249704c3a40ca36bf6.png
图1:横轴为富集到每个GO条目上面的基因数目

4bc3b91a90db32a443d0bd25da390fd4.png
图2: 横轴为GeneRatio

  • 1
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值