千人基因组计划数据库下载某段区域SNP

下载vcf文件：

方法一：进入ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/release/20130502/，直接下载相应染色体的vcf

方法二：进入http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/DataSlicer

 

假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据，“6”表示6号染色体，后面的数据表示距离。

按下图所示操作：

 

点击“run”，进入如下界面后，再点击“view results”

 

弹出如下界面，再点击“Download results file”。即可得到我们要的结果

 下载map文件和ped文件：

进入链接

 

点击后，弹出如下界面：

接着下载info文件和map文件：

 

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