泪奔，配好了bioconductor环境

        最近因为极度忙，没有写总结。今天补一下总结。

        今天完成关静最后给的大project这个作业来说，结合自己的研究方向是个让我纠结一周多的事。好在找到了对应的研究内容。

        R的书目前还是很多的。R我一开始觉得比较好用，甚至还有RStudio以及可视化效果。但是最后这个作业居然有个包下载后居然提示要3.0之前的R才能用。

        http://www.dxy.cn/bbs/topic/32033578

        丁香园里这位老兄说没装DBI包，于是装了，但是libraray("hgu95av2")还是不行呢。- -!

        费了一个小时，找到了办法：

        首先我下载的是这两个包：hgu95av2.db，org.Hs.eg.db。试了很多改里面文件配置的方法都不奏效。为了稳妥，在虚拟机里按照编译器的提示装了一个2.14版的R，然后libraray("hgu95av2")，居  然说AnnotationDbi没找到- -! 于是使用

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("AnnotationDbi")

        试了好几次，都说超时，第四次终于加载成功。

        之后在3.2.2里面使用libraray("hgu95av2")就可以了^_^

        相关网址：

        http://www.bioconductor.org/install/index.html#find-bioconductor-packages

        http://permalink.gmane.org/gmane.science.biology.informatics.conductor/46015

        http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/

        http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AnnotationDbi.html

       

转载于:https://www.cnblogs.com/ubiwind/p/5312567.html