GEO数据下载分析（SRA、SRR、GEM、SRX、SAMN、SRS、SRP、PRJNA全面解析）

很多时候我们需要从GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）下载RNA-seq数据，一个典型的下载页面是https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE76381（搜 GSE76381）。

这里你会看到数据的总览：

GSM2268339    1772067089_A01
GSM2268340    1772067089_A02
GSM2268341    1772067089_A03

……

Supplementary file    Size    Download    File type/resource
SRP/SRP067/SRP067844        (ftp)    SRA Study
GSE76381_ESMoleculeCounts.cef.txt.gz    5.9 Mb    (ftp)(http)    TXT
GSE76381_EmbryoMoleculeCounts.cef.txt.gz    5.3 Mb    (ftp)(http)    TXT
GSE76381_MouseAdultDAMoleculeCounts.cef.txt.gz    1.0 Mb    (ftp)(http)    TXT
GSE76381_MouseEmbryoMoleculeCounts.cef.txt.gz    6.1 Mb    (