一、下载安装Aspera Connect
Linux系统下的Aspera Connect安装(Windows下的Aspera Connect安装参考)。
查看最新版本的Aspera - High-speed file transfer software - aspera connect https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list
mkdir biotools && cd biotools
wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz &
tar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz
bash aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh #安装
cd # 去根目录
ls -a # 如果看到.aspera文件夹,代表安装成功
echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
ascp --help #ok
二、下载sra数据
Aspera用法如下:
ascp [参数] 目标文件 保存路径
-v verbose mode 实时知道程序在干啥
-T 取消加密,否则有时候数据下载不了
-i 提供私钥文件的地址
-l 设置最大传输速度,一般200m到500m,如果不设置,反而速度会比较低,可能有个较低的默认值