预测蛋白质在特定复合物中的状态有助于理解其在生物体内的生物学功能，从而设计药物来解决相关疾病。蛋白-蛋白对接是用来解释生物分子间作用模式常用的方法，以往常采用刚性对接，各原子的相对位置不变，虽然能够快速得到对接结果，但其忽略了侧链的摆动所造成的蛋白质分子的构象变化，得到的对接分数低，不容易探究到真正的结合模式。
近日来自杜伦大学的M. T. Degiacomi小组提出了一种表示蛋白质的新方法——STID(spatial and temporal influence density)图谱，它能够同时描述蛋白质的形状、静电学和局部动力学。基于这种方法发展了对接软件——JabberDock。该算法可以准确可靠地预测目标复合物的结合模式，柔性对接的平均成功率大于54%。该工作最近发表于美国化学会出版的理论计算化学核心期刊Journal of Chemical Theory and Computation(DOI：10.1021/acs.jcim.9b00356)。【1】
作者通过500 ps的动力学模拟对蛋白质侧链进行快速采样，将蛋白质放置在一个固定的立方体网格中，计算蛋白偶极矩的波动(Mv)。电荷是由模拟所用的力场得到的，对于带有净电荷的蛋白，Mv依赖于原点，因此网格在时间和空间上是固定的，可以通过偶极图表示分子所占空间的局部矢量静电性特征，
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