Li‘s 核磁共振影像数据处理-4-使用3D Slicer从DTI计算参数图（FA、ADC等）

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使用3D Slicer从DTI计算参数图

通过3D Slicer软件计算

主要步骤

1. 导入DICOM影像
   3D Slicer似乎只能支持DICOM格式和NRRD格式的DTI处理，而无法支持NIFTI+磁场梯度信息文件的方式。（这里不确定，如有错误请指正。）
   模块选择：
   

需要选择或设置的内容包括：选择DicomToNrrd，设置Output DWI Volume file，设置Input Dicom Data Directory。设置好后点击“Apply”。

2. 制作mask。
   实质就是去脑壳。
   模块选择：
   

需要设置的内容包括：Input DWI Volume，Output Baseline Volume，Output Diffusion Brain Mask。设置好后点击“Apply”。会生成Mask。

3. 扩散张量估计
   选择模块：
   

需要设置的参数包括：Input DWI Volume，Input Brain Mask，Output DTI Volume，Output Baseline Volume。设置好后点击“Apply”。

4. 参数计算
   模块选择：
   

需要设置或选择的内容包括：Input DTI Volume，Output Volume，Scalar Measurement。设置好后点击“Apply”。
此处以计算FA为例。

5. 查看结果
   模块选择：Data。
   

选择只查看FA map。

6. 保存结果
   模块选择：Save。
   

下期预告：使用代码的方式计算DTI的参数图。（比3D Slicer轻松方便多了。）

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