Li‘s 核磁共振影像数据处理-16-MRtrix3实现脑连接组connectome

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今日代码
tck2connectome [ options ] tracks_in nodes_in connectome_out
Example:
tck2connectome wmcsf_10Msift1Mtrack.tck ind_atlas_uint.mif result_connectome.csv -out_assignments streamlines
使用mrview查看connectome
mrview
File→open→选择影像

Tool→Connectome

Node image 选择node影像文件，即roi label文件。

Connectome matrices选择生成的连接矩阵文件，即刚生成的csv文件。