差异表达基因变化倍数_文章详细信息

程民;毛菊;杨雯雯;吴新春;陈稳;徐婷娟;沈国栋;胡世莲;

1:中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)安徽省老年医学研究所肿瘤免疫与营养治疗安徽省重点实验室

摘要(Abstract)：

目的探讨共生菌群对荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞(AM)基因表达的调控作用。方法分离纯化共生菌缺失的荷瘤小鼠及共生菌正常的荷瘤小鼠AM,利用基因芯片技术筛选差异表达的基因并进行生物信息学分析。结果分选后的AM细胞纯度可达98%,共生菌缺失荷瘤小鼠与正常荷瘤小鼠相比较,AM细胞中差异性表达基因共有353个(变化倍数≥2),上调基因171个,下调基因182个;差异表达基因的基因分类(GO)主要为细胞凋亡、细胞增殖、细胞分化、信号传导、血管生成等;KEGG通路主要为氮素代谢、趋化因子信号、TGF-β信号及肿瘤通路等;M2型巨噬细胞特异性基因CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等在共生菌缺失荷瘤小鼠AM细胞中表达上调。结论共生菌可以调控荷瘤小鼠AM细胞的基因表达,包括CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等基因,差异表达基因与多个GO分类和KEGG通路密切相关。

关键词(KeyWords)：

细菌;巨噬细胞,肺泡;基因表达调控;模型,动物

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation):

国家自然科学基金面上项目(81471552);;

安徽省科技攻关项目(1501041142);;

肿瘤免疫与营养治疗安徽省重点实验室绩效补助(2017070503B041,20183400002555)

作者(Author):

程民;毛菊;杨雯雯;吴新春;陈稳;徐婷娟;沈国栋;胡世莲;

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