差异基因p为0_RNAseq数据分析文献22差异基因与临床数据相关性分析

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Whole transcriptome analysis of smoker palatal mucosa identifies multiple downregulated innate immunity genes

吸烟者pa上黏膜的全转录组分析确定了多个下调的先天免疫基因

期刊：J. Periodontol 影响因子：2.768

发表单位：俄亥俄州立大学牙科学院

导 读

  思路：实验处理--> RNA-seq和差异基因分析 --> qPCR和免疫染色验证； 图表：实验处理图、 热图 、实验验证图； 差异基因表 、 差异基因相关性分析表 ，附加材料为 RNA-seq定量结果表 、 GO富集结果表 。

摘 要

  本文是一篇人牙周样品的RNA-seq数据分析文章，作者希望从RNA-seq数据中研究吸烟对牙周膜基因表达量的差异。摘要部分作者以背景、方法、结果、结论四个方面对该研究做了简述。

前 言

 

    背景部分介绍了吸烟对牙周膜的有害影响的研究背景，指出其通路机制尚未清楚。

方 法

  研究设计和研究人群 招募了牙周和全身健康的成人志愿者。一半为吸烟者，定义为每天吸烟≥10支香烟且≥5年(筛查时自我报告)，一半为不吸烟者(从未吸烟者)。每名志愿者均从结缔组织移植物的形式从from的随机选择的一侧(前磨牙区)收获pa组织活检。这些志愿者是a伤口愈合研究的一部分，其结果将在其他地方报道。研究方案和知情同意文件已获得俄亥俄州立大学(OSU)(协议)的机构审查委员会的批准＃2009H0283);该研究是根据1975年赫尔辛基宣言(于2013年修订)进行的。该研究的临床部分(志愿者招募和手术程序)于2009年4月至2011年5月进行。志愿者通过传单，海报和广告招募OSU卫生科学学院的公告栏，OSU报纸(灯笼，校园内)，OSU Today(校园范围的电子邮件