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通哥点评
clustalW是一款经典的多序列比对工具,在高通量测序开始之前已经被广泛使用了,具有非常高的引用率。可以进行多个同源基因的多序列比对,比对完成之后可以用于构建分子数。在高通量测序时代,ClustalW依然具有重要的作用。是一款需要掌握的生物信息工具。
一、功能分类:
多序列比对
二、软件官网:
http://www.clustal.org/clustal2/
三、软件介绍:
Clustal 系列软件广泛用于分子生物学的研究中。涉及的核酸、蛋白质的全局多序列比对,为进一步构建分子进化树等进化分析提供了基础。最初的版本名命名为Clustal,后来有了ClustalV,以及Clustal W和Clustal XClustalX相比ClustalW只是单存增加了图形化界面,最新的Clustal家族是Clustal Omega,在mega等软件中也集成了clustalw的比对。
四、下载安装:
wget http://www.clustal.org/download/current/clustalw-2.1.tar.gz
tar -zxvf clustalw-2.1.tar.gz
cd clustalw-2.1
configure
make
make install
五、软件使用:
ClustalW