SNP(全称Single Nucleotide
Polymorphisms)即单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性,包括单个碱基的转换、颠换等。
SNP作为第三代遗传标记,分布非常广泛,在遗传分析,疾病诊治,分子育种和种群生态评估等诸多领域有十分重要的意义。
进行SNP检测的方法有很多,如直接测序法、taqman探针法、massarray法、芯片法、高分辨率熔解曲线法、KASP法等。
如果要对tens or hundreds的SNP位点在hundreds or
thousands样本中进行检测,比如临床上指导用药相关SNP的检测(伴随诊断)、科研中对有限数量SNP的相关研究、潜在诊疗疾病相关SNP的大量样本验证等等,那么我们推荐你使用——massarray法!
massarray法是利用桌面式质谱仪来进行检测,具有检测成本低、周期短、灵活、实验操作和数据分析简单等特点,是中高通量靶点检测实验室的最佳选择。该技术目前已在全球范围内得到广泛应用,覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。
检测原理
massarray法基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(Matrix Assisted Laser Desorption
/Ionization-Time of Flight,
MALDI-TOF),该技术完美地整合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量和质谱技术的高精确度,是目前唯一应用质谱直接检测SNP的技术平台。
massarray法的优势
相对于其它SNP检测方法,massarray法的优势有很多&#x