kasp技术原理_KASP——基因分型研究者指尖跳跃的珠链

说起SNP Genotyping，大家熟悉的产品很多。例如*经典的Taqman荧光探针法，至今也是Genotyping的金标准。还有Sequenome Massarray飞行时间质谱法，在医学方向应用很多，也有很多商品化检测试剂盒，不过Sequenome需要引物组合做多重PCR，摸索优化难度比较大，耗材成本也不低。前几年大家经常提起的，高分辨熔融曲线HRM也算一个吧，HRM以高灵敏，低成本，灵活的优势深受不少科研工作者的喜爱，只是这项技术对于引物设计和实验操作，仪器的灵敏度和重复性要求都比较高，HRM都是针对一段DNA片段而不是一个位点进行熔融温度差异分析，片段的长短，碱基差异，碱基构成都是影响因素，重复性并不好，HRM更适合于寻找突变体，而非SNP检测，所以大部分客户体验并不好。

那么今天要分享的基因有限公司代理产品，英国LGC公司的KASP技术，原理上类似Taqman检测，也是基于终端荧光读取判断，每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型，不同的SNP模板对应不同的荧光产物。所以这项技术的准确度与金标准Taqman一致，而KASP技术与Taqman技术不同的是，它不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物，它基于自己独特的ARM PCR原理，让所有的位点检测*终都使用通用荧光引物扩增，这大大降低了LGC KASP的试剂成本，既有金标准的准确，又降低了使用成本，比Taqman还具有更好的位点适应性，所以在医学、农学检测方面LGC KASP都有非常好的应用，并在一系列高水平的文章中都有体现，后续我们会继续介绍。

从具体技术上比较࿰